La seule vraie bonne raison de choisir une spécialité plutôt qu'une autre est selon ton envie et ce que tu souhaites faire comme type de métier plus tard. C'est ce qui t'intéresse qui est primordial pour pouvoir t'épanouir dans ta vie professionnelle. S'il n'y a rien de déterminant pour faire ce choix, on peut déjà remarquer qu'on peut séparer l'agroalimentaire des deux autres types de production.
Par ordre décroissant de débouchés et sûrement de salaires associés :
1) agroalimentaire où tu pourras aisément travailler dans le privé et toucher de bons pactoles dans ce domaine qui évolue en permanence avec toujours de nouveaux poduits à imaginer... Pour faire un mauvais jeu de mots, c'est un domaine où on fait du blé.
2) la production végétale qui va demander peut-être des chercheurs sur ce domaine. Mais cela sera-t-il toujours pérenne dans les dizaines d'années à venir ? On peut le souhaiter, qu'en sera-t-il en réalité ? En tout cas d'énormes chantiers sont à faire avec les OGM ou pas OGM, les productions d'énergies nouvelles où on sera en recherche de végétaux fournissant plus d'énergie lors d'une mise dans un moteur plutôt que de nourir des bêtes ou des hommes... Bref, plein de choses nouvelles. Il faut par contre de réelles volontés gouvernemantales pour que du travail soit fait.
3) la production animale où on est toujours en recherche de plus de productivité, mais à mon sens il s'agit de faire "mieux" mais plus forcément nouveau, à moins de redécouvrir de l'ancien qui marchait bien. Et puis le production animale se fait de manière de plus en plus concentrée dans des unités de production de plus en plus énormes, donc en nombre plus réduits qui diminue l'offre d'emploi en la matière
A toi de voir ensuite avec tes affinités : j'aime les animaux ou pas et du coup si j'aime les animaux est-ce que je veux vraiment travailler dans la production animale ou finalement c'est parce que je les aime que je vais plutôt travailler dans un autre domaine ;-) Ma préoccupation est-t-elle plutôt financière ? Je veux travailler dans la recherche et plutôt dans des domaines liés au bien-être de la planète ?
Voilà pour ces quelques pistes :
Préoccupation argent ? agroalimentaire
Préoccupation recherche et environnement ? production végétale où les domaines de recherche sont infinis. Vérifier les débouchés selon l'endroit où tu veux travailler.
Pour la production animale, moi je ne vois presque pas pourquoi y aller. Mais c'est mon opinion personnelle.